Марк Помпоний Руф (лат. Marcus Pomponius Rufus; V — IV века до н. э.) — древнеримский политический деятель из плебейского рода Помпониев, один из шести военных трибунов с консульской властью 399 года до н. э..
Во время его трибуната римляне разбили капенцев и фалисков, пришедших на помощь Вейям.