Последним годом сколько-нибудь крупных успехов в исполнении пражанина становится сезон-2006: ряд успехов на «челленджерах» и соревнованиях основного тура (в их число входят и сразу два титула) позволяют ему к концу сезона подняться на 33-ю строчку рейтинга. Реанимированный союз с Визнером приносит титул в Вене.
В 2007-08 годах результаты постепенно идут на убыль и Пала вскоре завершает карьеру игрока. Последний турнир, ещё раз вспомнив прошлое, Петр вместе с Павлом Визнером проводит летом 2009 года — в Гштаде. Чехи уступают уже на старте и вместе прощаются с большим теннисом.
Карьера в миксте
За свою игровую карьеру Петр тринадцать раз принимает участие в турнирах Большого шлема в смешанном парном разряде. Наиболее удачными из них оказываются два: на Roland Garros-2001 он вместе со словачкой Жанеттой Гусаровой доходит до полуфинала, обыграв весьма сильные пары Зимонич / Среботник и Вудбридж / Стаббс. Спустя несколько месяцев весьма удачно проходит аналогичный турнир на Australian Open, где в паре с соотечественницей Кветой Грдличковой он выходит в четвертьфинал.
Тренерская карьера
Накануне сезона-2008, будучи ещё действующим игроком, Петр возглавил женскую команду Чехии в Кубке Федерации. Пражанину удалось уже в свой первый сезон вернуть сборную в элитную восьмёрку, а в 2011 году привести её к первому за тринадцать лет титулу в этом турнире.
Рейтинг на конец года
| Год | Одиночный рейтинг | Парный рейтинг |
| 2008 | | 111 |
| 2007 | | 64 |
| 2006 | | 33 |
| 2005 | | 75 |
| 2004 | | 35 |
| 2003 | | 43 |
| 2002 | | 38 |
| 2001 | | 16 |
| 2000 | | 56 |
| 1999 | | 99 |
| 1998 | 573 | 177 |
| 1997 | | 180 |
| 1996 | 460 | 134 |
| 1995 | 330 | 165 |
| 1994 | 447 | 232 |
| 1993 | | 398 |
Выступления на турнирах
Финалы турниров Большого шлема в парном разряде (1)
Поражения (1)
| № | Год | Турнир | Покрытие | Партнёрша | Соперники в финале | Счёт |
| 1. | 2001 | Roland Garros | Грунт | Павел Визнер | Махеш Бхупати Леандер Паес | 6-7(5) 3-6 |
Финалы Итогового чемпионата ATP в парном разряде (1)
Поражения (1)
| № | Год | Турнир | Покрытие | Партнёрша | Соперницы в финале | Счёт |
| 1. | 2002 | Бангалор, Индия | Хард | Павел Визнер | Эллис Феррейра Рик Лич | 7-6(6) 6-7(2) 4-6 4-6 |
Финалы турниров ATP в парном разряде (17)
Победы (7)
| Легенда: |
| Турниры Большого Шлема (0) |
| Masters Cup (0) |
| ATP Masters (0) |
| ATP International Gold (0+1) |
| ATP International (0+6) |
| Титулы по покрытиям | Титулы по месту проведения матчей турнира |
| Хард (0+2) | Зал (0+1) |
| Грунт (0+5) |
| Трава (0) | | Открытый воздух (0+6) |
| Ковёр (0) |
| № | Дата | Турнир | Покрытие | Партнёр | Соперники в финале | Счёт |
| 1. | 26 мая 2001 | Санкт-Пёльтен, Австрия | Грунт | Давид Рикль | Жайме Онсинс Даниэль Орсанич | 6-3 5-7 7-5 |
| 2. | 25 мая 2002 | Санкт-Пёльтен, Австрия (2) | Грунт | Давид Рикль | Майк Брайан Майкл Хилл | 7-5 6-4 |
| 3. | 22 мая 2004 | Санкт-Пёльтен, Австрия (3) | Грунт | Мариано Худ | Томаш Цибулец Леош Фридль | 3-6 7-5 6-4 |
| 4. | 31 июля 2005 | Умаг, Хорватия | Грунт | Иржи Новак | Михал Мертиняк Давид Шкох | 6-3 6-3 |
| 5. | 8 января 2006 | Ченнай, Индия | Хард | Михал Мертиняк | Пракаш Амритраж Рохан Бопанна | 6-2 7-5 |
| 6. | 15 октября 2006 | Вена, Австрия | Хард(i) | Павел Визнер | Юлиан Ноул Юрген Мельцер | 6-4 3-6 [12-10] |
| 7. | 20 июля 2008 | Умаг, Хорватия (2) | Грунт | Михал Мертиняк | Карлос Берлок Фабио Фоньини | 2-6 6-3 [10-5] |
