Очень рано — уже в 16 лет — Гантухова провела свой первый матч за национальную команду в Кубке Федерации: Даниэла была заявлена третьим номером на полуфинал турнира 1999 года против россиянок и сыграла в ничего не решавшей парной встрече. За следующие несколько лет, улучшая результаты личных турниров, словачка Гантухова постепенно стала и неотъемлемой частью заявки сборной, где она была одним из двух основных игроков на одиночные встречи; словацкая команда в начале 2000-х уверенно держалась в элитной группе турнира, а в 2002 году, впервые со времён объединённой сборной Чехословакии, добралась и до решающего матча, где в матчевой встрече против испанок, усилиями Даниэлы, сначала создала решающий отрыв, а затем и довела игру до победы. В 2004-05 годах Гантухова некоторое время не принимала участие в турнире, что стоило Словакии вылета в региональную зону турнира, однако уже в 2006 году при участии Даниэлы и ряда молодых теннисисток европейская команда уверенно выиграла свою группу и вернулась в элитный турнир. С момента дебюта Гантухова на протяжении 13 сезонов проводила в Кубке Федерации как минимум одну игру, успев переписать на себя лучшие результаты в истории сборной по числу лет участия в турнире, общему числу побед и побед только в одиночных матчах.
Даниэла принимала участие и в другом командном национальном турнире: австралийском Кубке Хопмана, став в сезоне-2003 третьей представительницей Словакии, сыгравшей в этом соревновании. Первый опыт ограничился участием в матчах групповой стадии, но уже в 2004 и 2005 годах словацкая команда добиралась до титульного матча: сначала уступив титул сборной США, а затем взяв верх над аргентинцами. В 2003 и 2005 годах партнёром Гантуховой выступал Доминик Хрбаты, а в 2004 году вместе с ней сыграл Кароль Кучера.
Будучи одним из лидеров национального тенниса на протяжении многих сезонов и стабильно держась в первой полусотне одиночного рейтинга словачка регулрно получала право играть в Олимпийском теннисном турнире, однако за три участия в нём Даниэла так и не выиграла ни одного матча в парном соревновании, а в одиночном лишь раз пробившись в третий раунд.
Рейтинг на конец года
| Год | Одиночный рейтинг | Парный рейтинг |
| 2015 | 81 | 82 |
| 2014 | 64 | 87 |
| 2013 | 33 | 49 |
| 2012 | 32 | 66 |
| 2011 | 24 | 18 |
| 2010 | 30 | 93 |
| 2009 | 24 | 13 |
| 2008 | 21 | 54 |
| 2007 | 9 | 44 |
| 2006 | 18 | 13 |
| 2005 | 19 | 13 |
| 2004 | 31 | 62 |
| 2003 | 19 | 28 |
| 2002 | 8 | 8 |
| 2001 | 37 | 56 |
| 2000 | 108 | 192 |
| 1999 | 201 | 279 |
Выступления на турнирах
Финалы турниров WTA в одиночном разряде (16)
Победы (7)
| Легенда: До 2009 года | Легенда: С 2009 года |
| Турниры Большого Шлема (0+0+4) |
| Олимпиада (0) |
| Итоговый чемпионат года (0) |
| 1-я категория (2+1) | Premier Mandatory (0+1) |
| 2-я категория (1+4) | Premier 5 (0) |
| 3-я категория (0+2) | Premier (0) |
| 4-я категория (0+1) | International (4) |
| 5-я категория (0) |
| Титулы по покрытиям | Титулы по месту проведения матчей турнира |
| Хард (6+5+2) | Зал (1+3) |
| Грунт (0+2+1) |
| Трава (1+1+1) | Открытый воздух (6+6+4) |
| Ковёр (0) |
| № | Дата | Турнир | Покрытие | Соперница в финале | Счёт |
| 1. | 16 марта 2002 | Индиан-Уэллс, США | Хард | Мартина Хингис | 6-3 6-4 |
| 2. | 18 марта 2007 | Индиан-Уэллс, США (2) | Хард | Светлана Кузнецова | 6-3 6-4 |
| 3. | 28 октября 2007 | Линц, Австрия | Хард(i) | Патти Шнидер | 6-4 6-2 |
| 4. | 13 февраля 2011 | Паттайя, Таиланд | Хард | Сара Эррани | 6-0 6-2 |
| 5. | 12 февраля 2012 | Паттайя, Таиланд (2) | Хард | Мария Кириленко | 6-7(4) 6-3 6-3 |
| 6. | 16 июня 2013 | Бирмингем, Великобритания | Трава | Донна Векич | 7-6(5) 6-4 |
| 7. | 15 февраля 2015 | Паттайя, Таиланд (3) | Хард | Айла Томлянович | 3-6 6-3 6-4 |
